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医院检验科PCR实验室开展检测项目之三,人基因多态性(SNP位点)类pcr检测

时间:2020-06-05 16:52 点击次数: 更多 荧光定量pcr pcr实验室 PCR检测 文章
 

PCR实验室确切的中文名应该是“临床基因扩增实验室”。

临床基因扩增实验室主要就是利用该项技术来达到检验的目的。今天,我们不解释PCR的原理,只要知道PCR就是通过检测遗传物质DNA(或RNA)就足够了,并且这种方法的特点有:

1、灵敏度高;
2、特异性好;
3、简单快速。
该项技术从诞生发展到现在也就几十年时间,但因为其优秀的特点,临床应用也越来越广,从病原体的核酸定量检测、基因分型,扩展到肿瘤基因突变、融合基因检测等,PCR技术因为其灵敏度比较高,随之而来的污染问题也是很严重的,所以PCR实验室最重要的工作就是防污染,这其中就包括规范化实验室的建设、质量管理体系的建立等等。


基因多态性通俗来说就是,人类的基因绝大部分都是相同,造成你我不一样的原因就是基因多态性导致的,比如某个基因的某个碱基,一般人都是A,但是天赋异禀的人是T。

人基因多态性(SNP位点)常见检测项目

1.  HLA-B*5801基因多态性检测

别嘌呤醇是治疗痛风的一线药物,是目前唯一的黄嘌呤氧化酶抑制剂。该药可引起严重的副作用,包括Stevens-John综合症(SJS)及中毒性表皮坏死症(TEN)。研究表明HLA-B*5801等位基因与别嘌呤醇引发的严重副反应呈很强的相关性,尤其在汉族人群中高达100%,几乎所有副反应的患者都是HLA-B*5801的携带者,而别嘌呤醇耐受者中只有15%左右的HLA-B*5801携带者。通过检测HLA-B*5801等位基因可以预防别嘌呤醇引发的SJS和TEN。

2.  人类 ALDH2 基因多态性检测

ALDH2 基因是一个可以影响酒精以及硝酸甘油代谢的基因,突变型基因ALDH2*2导致乙醛脱氢酶活力的严重缺失。在饮酒人群中, 携带该基因型的人解酒能力差、喝酒容易脸红,更容易发生酒精性中毒、酒精性肝病、消化道癌症等疾病。
ALDH2*2 突变人群患肝癌、食道癌、口腔癌的概率分别是 ALDH2*1 野生人群的 3 倍、 12.95 倍、 11.72 倍以上。硝酸甘油(GTN)是治疗心绞痛的经典药物,但该药的临床有效性常因人而异,部分病人舌下含服硝酸甘油不能迅速有效地缓解心绞痛,使心肌严重缺血加重。

3.  人MTHFR基因多态性检测

人MTHFR基因第677密码子由C突变成T可导致其编码的亚甲基四氢叶酸还原酶(MTHFR酶)的活性降低,引起叶酸代谢障碍,造成叶酸水平降低、同型半胱氨酸升高及DNA甲基化,从而造成一系列的病理改变,引发多种疾病。
于佳梅等对中国5个民族MTHFR基因多态性进行了研究,结果显示,汉族人677T等位基因频率为40%,达斡尔族人为45%,认为亚洲人MTHFR基因677C→T突变频率偏高。通过检测人MTHFR c.677 位点基因突变情况可以指导同型半胱氨酸升高患者叶酸治疗的用药。

4.  人ADRB1基因多态性

人β1肾上腺素受体的编码基因ADRB1具有遗传多态性,常见多态性类型为c.1165位点(G/C)核苷酸多态性,其会导致β1肾上腺素受体氨基酸出现Gly389Arg多态性。临床试验发现,β1肾上腺素受体阻断药美托洛尔降低患者心率的效果与β1肾上腺素受体Gly389Arg多态性有关,可根据患者的基因型调整相应的给药剂量,以提高疗效,降低不良反应。


研究发现, ALDH2*1 基因型的患者硝酸甘油治疗心绞痛的疗效明显优于 ALDH2*2 患者, ALDH2*2 突变型的患者使用无效率达到 42.4%,大约为 ALDH2 野生型的 3 倍。因此,存在突变型 ALDH2*2 的患者硝酸甘油用药剂量及用药频率应相应增加,延长用药周期。

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